Eclipse trae de serie una componente denominada Egit que proporciona una interfaz bastante completa de las operaciones con Git. Para acceder a ella, hay que ir a la perspectiva Git (en el menú Window > Open Perspective > Other…, y entonces seleccionar "Git").
EGit tiene una completa documentación, a la que se puede acceder yendo a Help > Help Contents, y seleccionando el nodo "EGit Documentation" en el listado de contenidos.