-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
dummy.txt
38 lines (38 loc) · 4.64 KB
/
dummy.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
@SQ SN:1 LN:248956422
@SQ SN:2 LN:242193529
@SQ SN:3 LN:198295559
@SQ SN:4 LN:190214555
@SQ SN:5 LN:181538259
@SQ SN:6 LN:170805979
@SQ SN:7 LN:159345973
@SQ SN:8 LN:145138636
@SQ SN:9 LN:138394717
@SQ SN:10 LN:133797422
@SQ SN:11 LN:135086622
@SQ SN:12 LN:133275309
@SQ SN:13 LN:114364328
@SQ SN:14 LN:107043718
@SQ SN:15 LN:101991189
@SQ SN:16 LN:90338345
@SQ SN:17 LN:83257441
@SQ SN:18 LN:80373285
@SQ SN:19 LN:58617616
@SQ SN:20 LN:64444167
@SQ SN:21 LN:46709983
@SQ SN:22 LN:50818468
@SQ SN:X LN:156040895
@SQ SN:Y LN:57227415
@SQ SN:MT LN:16569
@RG ID:SLX-9168 PL:illumina PU:run LB:SLX-9168 SM:D701_D501 CN:CamObsGynae
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_1.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_2.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_3.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_4.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_5.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_6.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_7.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C6H3UANXX.s_8.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C7MGMANXX.s_1.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C7MGMANXX.s_2.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C7MGMANXX.s_3.r_1_trimmed.fq.gz
@PG ID:bwa PN:bwa VN:0.7.17-r1188 CL:bwa mem -t 32 -T 19 -U 15 -R @RG\tID:SLX-9168\tPL:illumina\tPU:run\tLB:SLX-9168\tSM:D701_D501\tCN:CamObsGynae /home/ssg29/data/genome/Homo_sapiens/Ensembl/GRCh38/Sequence/BWAIndex/genome.fa /home/ssg29/results/SLX-9168.Homo_sapiens.SE125.v2/Trim/D701_D501/SLX-9168.D701_D501.C7MGMANXX.s_4.r_1_trimmed.fq.gz