Ce dépôt contient un TD portant sur la capture d'insectes ('TD Simulation Barber.ipynb') et son corrigé ('CORRIGE TD Simulation Barber.ipynb').
Objectif
L'objectif de ce TD est de construire un modèle permettant d'estimer la densité d'insectes dans un champ, à partir de mesures de leur activité-densité et de leur activité.
Description
Le TD est organisé en trois temps, chacun associé à une ou plusieurs questions. Nous chercherons d'abord comment simuler (et visualiser) la capture d'insectes dans des pièges Barber ('Visualisation Exemple.mp4'). Ensuite, nous mobiliserons ces simulations pour construire des bases de données donnant l'activité-densité ('data_simulated.xlsx') et l'activité ('data_simulated_dispersion.xlsx') de populations virtuelles d'insectes sur différents types de parcelles. Enfin, nous définirons un modèle bayésien hierarchique fondé sur une représentation mécaniste des processus de diffusion et de capture permettant de relier les mesures d'activité-densité et d'activité à une estimation de la densité d'insectes. Ce modèle sera calibré dans le TD, mais les résultats de la calibration (Echantillons) sont également disponibles dans ce dépôt ('Données\Echantillon_MCMC_Model_Dispersion_et_Densité.nc')