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Get Semáforo Epidemiológico Data from 🇲🇽 Mexico COVID-19 Response

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Bisaloo/semaforos

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semaforos

Lifecycle: maturing Codecov test coverage R-CMD-check

The semaforos R package provides easy access to historical data of Semáforos Epidemiológicos, which are part of the COVID-19 response strategy of Mexico. The Semáforos define 4 degrees of alert at the State level and are re-evaluated weekly.

El paquete de R semaforos proporciona un facil acceso a los datos historicos de los Semáforos Epidemiológicos, los cuales forman parte de la estrategia de respuesta del Gobierno Mexicano contra la pandemia del COVID-19. Los Semáforos poseen 4 grados de alerta que se aplican a cada Estado por una semana.

Explanation of the different levels

Installation

You can install the development version of this package from GitHub:

Puedes instalar la ultima version de este paquete desde GitHub:

remotes::install_github("Bisaloo/semaforos")

The data can also be directly used by downloading the csv file.

Tambien puedes descargar los datos directamente desde aqui.

Usage

library(semaforos)
sw <- semaforos_get(format = "wide")
head(sw)
#>                estado 2020-W22 2020-W23 2020-W24 2020-W25 2020-W26 2020-W27
#> 1      Aguascalientes     rojo     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 2     Baja California     rojo     rojo     rojo     rojo     rojo     rojo
#> 3 Baja California Sur     rojo     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 4            Campeche     rojo     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 5             Chiapas     rojo     rojo     rojo     rojo  naranja     rojo
#> 6           Chihuahua     rojo     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja
#>   2020-W28 2020-W29 2020-W30 2020-W31 2020-W32 2020-W33 2020-W34 2020-W35
#> 1  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja     rojo     rojo  naranja
#> 2     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 3  naranja     rojo     rojo     rojo     rojo     rojo     rojo  naranja
#> 4  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo amarillo
#> 5     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo
#> 6  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo
#>   2020-W36 2020-W37 2020-W38 2020-W39 2020-W40 2020-W41 2020-W42 2020-W43
#> 1  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo  naranja  naranja  naranja
#> 2  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo amarillo amarillo  naranja
#> 3  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo  naranja
#> 4 amarillo amarillo amarillo    verde    verde    verde    verde    verde
#> 5 amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo
#> 6 amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo  naranja  naranja     rojo
#>   2020-W44 2020-W45 2020-W46 2020-W47 2020-W48 2020-W49 2020-W50 2020-W51
#> 1  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 2  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja     rojo     rojo     rojo
#> 3  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo  naranja  naranja  naranja
#> 4    verde    verde    verde    verde    verde    verde    verde    verde
#> 5 amarillo amarillo amarillo    verde    verde    verde    verde    verde
#> 6     rojo     rojo     rojo     rojo     rojo  naranja  naranja  naranja
#>   2020-W52 2021-W01 2021-W02 2021-W03 2021-W04 2021-W05 2021-W06 2021-W07
#> 1  naranja amarillo amarillo  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 2     rojo     rojo     rojo  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo
#> 3  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja
#> 4    verde    verde    verde    verde    verde amarillo amarillo amarillo
#> 5    verde    verde    verde amarillo amarillo amarillo amarillo    verde
#> 6  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo  naranja  naranja amarillo
#>   2021-W08 2021-W09 2021-W10 2021-W11 2021-W12 2021-W13 2021-W14 2021-W15
#> 1  naranja  naranja amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo
#> 2 amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo
#> 3  naranja  naranja amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo  naranja
#> 4 amarillo amarillo    verde    verde    verde    verde    verde    verde
#> 5    verde    verde    verde    verde    verde    verde    verde    verde
#> 6 amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo  naranja  naranja  naranja
#>   2021-W16 2021-W17 2021-W18 2021-W19 2021-W20 2021-W21 2021-W22 2021-W23
#> 1 amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo    verde    verde    verde
#> 2 amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo amarillo
#> 3  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo amarillo  naranja
#> 4    verde    verde    verde    verde    verde amarillo amarillo amarillo
#> 5    verde    verde    verde    verde    verde    verde    verde    verde
#> 6  naranja  naranja  naranja  naranja  naranja amarillo amarillo amarillo
sl <- semaforos_get(format = "long")
head(sl)
#>                estado year week color
#> 1      Aguascalientes 2020   22  rojo
#> 2     Baja California 2020   22  rojo
#> 3 Baja California Sur 2020   22  rojo
#> 4            Campeche 2020   22  rojo
#> 5             Chiapas 2020   22  rojo
#> 6           Chihuahua 2020   22  rojo

Data source

The data is scraped weekly from the Mexican federal government website using the httr and the xml2 packages.

Los datos son extraidos semanalmente desde el sitio web del gobierno Mexicano con los paquetes httr y xml2.

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